Coins: Moedas estão por toda a ilha. Ao coletá-las a vida de
Mario será recuperada. Ao coletar 100 delas, um Shine secreto aparecerá.
Blue Coins: Moedas azuis recuperam dois pontos de vida de
Mario. Existe um vendedor que troca estas moedas por Shines em Delphino Plaza.
Red Coins: Existem oito destas por fase e cada moeda
recupera dois pontos de vida. Colete todas 8 moedas numa mesma vida para pegar um Shine Sprite.
Water Bottles: Há garrafas que enchem o tanque de FLUDD. Garrafas
pequenas preenchem o tanque pela metade e garrafas grandes enchem-no.
1-UP Mushroom: Pegue um destes cogumelos mágicos para ganhar
uma vida. Eles também irão encher o medidor de vida de Mario e o tanque de FLUDD.
Hover Nuzzle: Muda o bocal secundário de FLUDD para o modo de
flutuação. Com ele Mario pode flutuar por um tempo limitado.
Rocket Nuzzle: Muda o bocal secundário de FLUDD para o modo de
foguete. Com ele Mario pode ir para cima numa explosão de vapor de água.
Turbo Nuzzle: Muda o bocal secundário de FLUDD para o modo de
turbo. Com ele Mario pode sair correndo em alta velocidade.
Bianco Hills: A primeira fase se passa nas colinas, onde há um
imenso moinho de vento e uma belo lago, só que tudo está sujo com a misteriosa tinta. Mario
terá que abrir caminho com a ajuda de FLUDD. Aqui você enfrentará duas vezes Petey Piranha,
uma planta carnivora com pernas e que consegue voar um pouco. A primeira vez que voc~e o verá
será no topo do moinho e depois na parte mais alta das colinas.
Ricco Harbor: O porto de Delphino Isle também está todo sujo com a
maldita tinta. A água está tod imunda no início e para ter acesso a algumas partes é necessário
surfar em cima dos Glooper Blooper, uns peixões bem esquisitos. Acima da água é um enorme andaime,
que deve ser explorado na busca pelos Shines Sprites e também na perseguição a Shadow Mario.
Esta fase não é difícil, mas pode assustar no início.
Gelato Beach: Finalmente a praia! Você começará fazendo um tour
pelas areias a beira-mar. Mas ao adentrar o local, você verá uma estranha estrutura com três
espelhos enormes envolta dela e uma enorme Wiggler em cima. Esse local é um dos
pontos chaves da fase, pois daqui voc~e encontrará diversos Shines Sprites. Mas não
deixe de explorar o resto da praia, pois há muitas coisas legais lá.
Pinna Park: A quarta fase se passa no parque de diversões da ilha.
É aqui que o vilão Shadow Mario levou Peach. Ao entrar no parque você terá de enfrentar
Mech-Bowser e após vencê-lo, o vilão mostrará sua verdadeira identidade. Além do parque, há uma
pequena praia onde você começa o estágio. Se explorá-la, encontrará algumas enormes flores e
também um canhão.
Noki Bay: Esta é a baia dos Nokis, habitantes da ilha, assim como os
Piantas. No local existe uma enorme cachoeira, mas quando você chegar na fase, ela estará
com uma enorme rolha colocada pelos inimigos e cabe a Mario a tarefa de liberá-la. Perto desta
cachoeira há ruínas que escondem secretos envolvendo os Shine Sprites. Para ter acesso a elas
Mario deverá passar por estranhas paredes que se movem ao serem molhadas.
Sirena Beach: Mais uma bela praia. Ao chegar, Mario descobre que
deveria haver um hotel ali, mas não há. Ele logo descobre que o responsável é uma arraia feita
da misteriosa tinta. Ao limpar essa sujeira, o hotel voltará e Mario poderá visitar o aconchegante
local só para descobrir que ele está tomado de Boos, o que leva o bigodudo a enfrentá-los em
busca dos Shine Sprites.
Pianta Village: A última das fases se passa na vila dos Piantas.
Ao chegar, Mario verá enormes Chain Chomps soltos pelo local assutando os habitantes. Após
resolvar a confusão o encanador poderá explorar o local, onde há uma enorme árvore da qual a
queda pode ser mortal. Além disso aqui Shadow Mario aprontará as suas últimas. Todo o cuidado é
pouco, pois a vila fica suspensa em um enorme penhasco.
Corona Mountain: O último local do jogo não é uma fase, mas o
caminho para enfrentar Bowser e seu filho. No começo Mario deverá flutuar de plataforma em
plataforma e evitar cair na lava. Depois deverá navegar em um barco pelo magma escaldante
usando o jato de FLUDD. Por fim, Mario deverá subir com a ajuda do foguete de FLUDD e várias
nuvens para chegar ao local de sua batalha final.