No ano de 2004, o Sonic Team lança o terceiro game Sonic Advance. O jogo segue ainda no portátil da Nintendo. O jogo agora conta com muitas novidades. Mais correria na telinha, agora em equipe. Ele continua no mesmo estilo dos primeiros games, tentando manter o estilo clássico dos jogos do Genesis. Agora o jogo conta com um sistema de duplas, como em Chaotix, onde você controla um personagem e tem um parceiro para ajudá-lo. Você começa com Sonic e Tails no início do jogo, mas habilitará os outros conforme o andamento do game. Além de liberar personagens, você deve percorrer todas as fases com eles recolhendo as Chaos Emeralds.
A estória do jogo está um pouquinho melhor que as dos dois anteriores.
Eggman usou o Chaos Control para dividir o mundo em sete partes, para assim dominá-lo.
Cabe agora a Sonic encontrar os seus amigos e impedir o cientista louco. O ouriço deve
novamente recolher as sete Esmeraldas do Caos para poder unificar o mundo.
Você tem apenas Sonic e Tails para formar duplas no início do jogo, mas conforme você
progride com eles, Knuckles, Amy e Cream vão sendo liberados.
Depois de recolher as Chaos Emeralds,
você também poderá jogar como o Super Sonic e, acredite se quiserem, Eggman.

Cada curso tem três estágios mais o chefe.
Você tem os Chao escondidos pelas zonas. Ao coletar os dez Chao de
um estágio, aparecerá a Special Key em um dos três atos. Com esta chave você pode
liberar a Special Spring. Completando todos sete estágios especiais, após a Angel Island (Zona Final)
você abri mais uma: a zona extra.
Os cinco personagens possuem características próprias.
Dependendo do seu parceiro, você poderá perder algumas delas e ganhar outras.
Sonic Advance 3 é um jogo bem legal, mais legal que os dois
antecessores.
Por ser um jogo a parte, a estória sequer aparece.
Mas mesmo assim, o Sonic Team fez um ótimo trabalho com este game também, sendo o melhor da
triologia Advance.