Além dos itens descritos na sessão Itens Normais, existe um tipo de item bem peculiar, os Itens de Upgrade.
| Big |
| Power Rod Depois do estágio Twinkle Park, vá para a floresta tropical em Mystic Ruins. Agora siga até a cabana de Big. Embaixo de sua cama está o Power Rod. Esta vara terá um alcance de captura maior. |
| Life Belt Depois de pegar a Power Rod volte para a estação e siga para Ice Cap. Quando entrar na caverna de gelo, você verá o Life Belt. Isto fará Big flutuar e poder nadar debaixo da água. Para afundar basta apertar o botão de pulo. Soltando, Big começa a flutuar na água. |
| Lure PowerUp #1 Logo no início do jogo. Ao chegar em Station Square, vá até os esgotos localizados atrás de Twinkle Park para pegar o Lure Powerup. Isto ajudará a pegar o peixe maior. |
| Lure PowerUp #2 Depois de Twinkle Park pegue o trem. Quando chegar em Mystic Ruins, vá em direção a floresta tropical. Há uma caverna próxima ao homem que diz que deixou sua mulher em Station Square. Para achar a caverna, vá pelo caminho mais a direita no início, siga em frente, direita, frente e direita até você achar o homem e a caverna e pegar o segundo Lure Powerup. |
| Lure PowerUp #3 Dentro do estágio Ice Cap, onde Froggy está logo no início. Mas antes de pescá-lo, afunde na água e ache uma passagem. Você sairá em uma outra parte da fase. Ache uma ossada de dinossauro. Perto da parte da cabeça você achará outro Lure. |
| Lure PowerUp #4 Ao chegar na fortaleza voadora de Eggman, vá até a prisão de Egg Carrier e você encontrará o último Lure Powerup. |