Os estágios de Sonic the Hedgehog CD são divididos em três atos que você deve concluir. No terceiro e último ato você enfrentará Eggman em uma de sua invenções malucos para poder resgatar s sementes de flores que foram capturadas.
Da mesma forma que em Sonic the Hedgehog, ao final de cada um dos dois primeiros atos, Sonic passará por uma placa com o
rosto de Eggman. Quando nosso herói azul passar, a placa girará e mostrará o rosto de Sonic, simbolizando
que aquela área não é mais dominada pelo cientista louco, mas agora está livre.
Diferente de Sonic the Hedgehog, aqui não há os pontos ocultos. Porém o anél gigante que
leva Sonic ao Estágio Especial aparece como no jogo anterior, ao terminar o ato com
cinquenta anéis.
No final do ato 3 Sonic enfrenta Eggman. Você deve derrotá-lo para poder
concluir o ato e, consequentemente, a zona.
Ao derrotar o cientista louco, ele foge. Siga-o até alcançar o ovo-jaula.
Pise no botão que está acima para libertar as sementes que cairão no chão e se
transformarão em enormes flores.